Медком | QIAGEN | Секвенатор GeneReader

Секвенатор GeneReader

Система секвенирования NGS для онкологических исследований GeneReader

Система секвенирования GeneReader является воплощением подхода компании QIAGEN в генетическом анализе «от Образца к Результату». Впервые в мире разработанное решение для NGS анализа в онкологии позволит автоматизировать сразу все этапы проведения исследования: выделение ДНК, создание библиотек ДНК, клональная амплификация, секвенирование, анализ данных и интерпретация обнаруженных вариантов.

Новая технология проведения NGS анализа позволит стандартизировать все этапы пробоподготовки, обеспечить единый стандарт проведения исследования, увеличить производительность и воспроизводимость получаемых результатов.

Ключевые особенности системы GeneReader

Единая система: от образца до результата

Единая система секвенирования GeneReader включает в себя полностью совместимые и интегрированные станции, а также наборы реагентов для всех этапов проведения исследования: выделение ДНК, создание библиотек ДНК, контроль качества библиотек, секвенирование, анализ и интерпретация полученных результатов.

Автоматизированный биоинформатический анализ и Интерпретация результатов

Программное обеспечение QIAGEN Clinical Insight - Analyze специально адаптировано для онкологических исследований и позволяет полностью автоматизировать вторичный анализ данных секвенирования.

QCI Interpret – уникальное и доступное решение для интерпретации NGS данных, которое позволяет интерпретировать каждый обнаруженный вариант, основываясь на рекомендациях по лечению и последних научных данных. QCI Interpret – помощник в принятии решений при проведении клинических исследований. В зависимости от обнаруженного геномного ландшафта опухоли программа создает отчеты с подбором соответствующих FDA-одобренных таргетных препаратов или препаратов, проходящих клинические испытания.

 

Панель GeneRead Actionable Insight Tumor Panel

Панель для целевого обогащения GeneRead Actionable Insight Tumor Panel позволяет анализировать 12 генов-драйверов рака: KRAS, NRAS, KIT, BRAF, PDGFRA, ALK, EGFR, ERBB2, PIK3CA, ERBB3, ESR1, RAF1. Кроме того, панель была специально разработана для работы с высоко фрагментированной ДНК, полученной из парафиновых блоков (FFPE) или образцов плазмы. Такой дизайн панели позволяет эффективно выявлять клинически значимые варианты, которые обнаруживаются при самых распространенных и социально значимых онкологических заболеваниях: рак молочной железы, рак яичников, колоректальный рак, рак легких, меланома.

Панель GeneRead QIAact AIT DNA UMI Panel

Расширенная универсальная панель позволяет анализировать 30 генов: AKT1, ALK1, BRAF, CTNNB1, DDR2, EGFR, ERBB2, ERBB3, ERBB4, ESR1, FBXW7, FGFR1, FGFR2, FGFR3, FLT3, GNA11, GNAQ, HRAS, KIT, KRAS, MAP2K1, MAP2K2, MET, NOTCH1, NRAS, PDGFRA, PIK3CA, RAF1, SMAD4, STK11.

Благодаря технологии молекулярного баркодирования UMI и обновленному дизайну, панель обладает повышенной чувствительностью и более однородным покрытием, а также позволяет анализировать CNV. 

Панель GeneRead QIAact Lung Panel

Комплексная панель GeneRead QIAact Lung All-in-One Assay (включающая панели GeneRead QIAact Lung UMI DNA panel и QIAact Lung UMI RNA fusion panel) объединяет в одном тесте все типы мутаций, включая одиночные нуклеотидные варианты (SNV), большие вставки и делеции (InDels), вариации числа копий генов (CNV) и фьюжены. Панель адаптирована для жидкостной биопсии и FFPE, а использование технологии молекулярного баркодирования (UMI) гарантирует снижение ошибок при анализе вариантов и обеспечивает высокую чувствительность при их обнаружении.

Анализируемые гены: AKT1, ALK, BRAF, DDR2, EGFR, ERBB2/HER2, ESR1, FGFR1, KIT, KRAS, MAP2K1, MET, NRAS, NTRK1, PDGFRA, PIK3CA, PTEN, RICTOR, ROS1.

Анализируемые фьюжены: AGTRAP-BRAF, AKAP9-BRAF, ATIC-ALK, CCDC6-RET, CD74-NRG1, CD74-NTRK1, CD74-ROS1, CEP89-BRAF, CLCN6-BRAF, CLTC-ALK, DCTN1-ALK, EML4-ALK, ERC1-RET, ERC1-ROS1, ESRP1-RAF1, EZR-ROS1, FAM131B-BRAF, FCHSD1-BRAF, FGFR1-PLAG1, FGFR1-TACC1, FGFR1-ZNF703, FGFR3-TACC3, FN1-ALK, GATM-BRAF, GNAI1-BRAF, GOLGA5-RET, GOPC-ROS1, HACL1-RAF1, HERPUD1-BRAF, HIP1-ALK, HOOK3-RET, KIF5B-ALK, KIF5B-RET, KLC1-ALK, LMNA-NTRK1, LRIG3-ROS1, LSM14A-BRAF, MET exon 14 skipping, MKRN1-BRAF, MYO5A-ROS1, NCOA4-RET, NPM1-ALK, NTRK1-TPM3, PCM1-RET, PPFIBP1-ALK, PPFIBP1-ROS1, PRKAR1A-RET, PWWP2A-ROS1, RAF1-DAZL, RANBP2-ALK, RNF130-BRAF, SDC4-ROS1, SEC31A-ALK, SLC34A2-ROS1, SLC45A3-BRAF, SQSTM1-ALK, STRN-ALK, TFG-ALK, TFG-NTRK1, TPM3-ALK, TPM3-NTRK1, TPM3-ROS1, TPM4-ALK, TRIM24-RET, TRIM33-RET, UBE2L3-KRAS, VCL-ALK, ZSCAN30-BRAF.

Панель GeneRead QIAact BRCA 1/2 Panel

Панель позволяет анализировать соматические и герминальные мутации в генах BRCA1 и BRCA2.

Панель GeneRead QIAact BRCA Advanced DNA UMI Panel

Расширенная панель позволяет анализировать соматические и герминальные мутации в 4 генах: BRCA1, BRCA2, TP53, PTEN.

Панель QIAact Myeloid DNA UMI Panel

Панель QIAact Myeloid DNA UMI Panel охватывает 25 высоко релевантных генов и их вариантов, включая однонуклеотидные замены (SNV) и вставки/делеции (InDels), имеющие известное клиническое значение при клональных злокачественных заболеваниях кроветворной системы. Целевые гены были тщательно отобраны по их распространенности и значимости при миелоидных злокачественных новообразованиях, заявленных международными организациями и объединениями, включая классификационные категории ВОЗ 2016 года, рекомендации NCCN, европейскую сеть по изучению лейкозов (ELN), MPN, MPNr-EuroNet и европейское общество медицинской онкологии (ESMO).

Список анализиреумых генов: ASXL1, CALR, CBL, CEBPA, CSF3R, DNMT3A, EZH2, FLT3, IDH1, IDH2, JAK2, KIT, KRAS, MPL, NPM1, NRAS, RUNX1, SETBP1, SF3B1, SH2B3/LNK, SRSF2, TET2, TP53, U2AF1, ZRSR2.

Кастомные панели GeneRead QIAact Custom DNA и RNA Panels

Кастомные панели с использованием технологии UMI могут быть разработаны для обнаружения всех типов генетических вариантов, включая соматические мутации, одиночные нуклеотидные варианты (SNV), вариации числа копий генов (CNV), вставки и делеции (InDels), фьюжены.

QIAGEN Clinical Insight (QCI) Interpret

Новое программное обеспечение QCI Interpret разработано для интерпретации результатов NGS анализа специально для лабораторий, занимающихся исследованиями в области онкологии.

С QCI Interpret вы можете аннотировать, проводить оценку и получать отчеты о каждом обнаруженном NGS варианте, базируясь на данных более 10 миллионов находок из базы знаний QIAGEN. База знаний постоянно обновляется и курируется специалистами QIAGEN на протяжении уже более 16 лет. Такой подход позволил QIAGEN консолидировать и структурировать современные представления о генетических вариантах, в частности, в онкологии, и создать новые инструменты для анализа.

QCI Interpret использует структурированную базу знаний QIAGEN, которая содержит данные как из открытых источников информации, так и из эксклюзивных баз данных.

Ключевые особенности:

  • Ясная классификация обнаруженных вариантов.

  • Сфокусированный анализ на клинически значимых мутациях, данных клинических испытаний и подборе FDA-одобренных препаратов.

  • Постоянно обновляемая и курируемая специалистами QIAGEN база знаний, содержащая новые генетические варианты, последние данные о проводимых клинических исследованиях, рекомендации по лечению и научные публикации.

  • Генерация подробных и ясных отчетов со ссылками на источники.

  • Возможность создания своей собственной, основанной на ваших находках, базы данных, которая позволит увеличить скорость и точность последующих интерпретаций.

  • QCI Interpret позволит минимизировать сложности, время и затраты, связанные с определением потенциальной значимости обнаруженных вариантов в ходе вашего NGS исследования.

Please reload

© 2018-2020 ООО "Медком", г. Москва. medkom.ooo@yandex.ru