Готовые панели QIAGEN для анализа химерных транскриптов методом NGS

Готовые панели QIAGEN для анализа химерных транскриптов методом NGS

Наборы реагентов серии QIAseq Targeted RNAscan Panels разработаны для детекции химерных транскриптов методом цифрового секвенирования (Digital NGS), основанного на молекулярном баркодировании кДНК. 


Цифровое секвенирование – уникальная технология, при которой индексирование фрагментов ДНК происходит при помощи молекулярных баркодов еще до проведения этапа амплификации, что позволяет избежать возникновения ПЦР-дупликатов и биаса. Кроме того, уникальная технология отжига и удлинения единственного праймера позволяет детектировать новые ранее неизвестные химерные варианты, а запатентованная технология анализа данных обеспечивает точную детекцию низкокопийных гибридных транскриптов.



Концепция молекулярного баркодирования заключается в том, что каждая оригинальная молекула-мишень «помечается» уникальной последовательностью «штрих-кода» перед этапом амплификации. Это достигается путем лигирования двойной цепи кДНК мишени с таким «штрих-кодом» или индексом, содержащим 12-нуклеотидную случайную последовательность (например, TATCGTACAGAT). Статистически, такая последовательность обеспечивает 412 = 16 777 216 уникальных комбинаций для каждого баркода и, таким образом, каждая цепь кДНК в образце получает уникальную последовательность.


Каждая панель QIAseq RNAscan Panel содержит все необходимые компоненты для обогащения и создания библиотек. Данные наборы адаптированы для различных моделей секвенаторов Illumina и Thermo Fisher Scientific. Наборы содержат специфические единственные праймеры для обогащения интересующих участков, что позволяет уменьшить общее количество праймеров. Все праймеры собраны в индивидуальные пулы для того, чтобы сократить число манипуляций и количество пулов при работе с панелями. Платформ-специфичные индексы позволяют секвенировать до 384 образцов за один запуск прибора.


Более подробная информация о панелях QIAseq Targeted RNAscan Panels доступна на сайте QIAGEN: https://www.qiagen.com/us/shop/sample-technologies/rna/qiaseq-targeted-rnascan-panel

© 2018-2020 ООО "Медком", г. Москва. medkom.ooo@yandex.ru