Технологии

Около 200 технических патентов Genemind реализовались в линейку первоклассных приборов высокопроизводительного секвенирования.

Совместимость

Совместимость с NGS библиотеками TruSight Oncology позволяет гибко планировать работу лабораторий.

Новый уровень качества

SURFSeq 5000 является настольной системой высокопроизводительного секвенирования. Она ориентирована в первую очередь на полногеномное, полноэкзомное и транскиптомное секвенирование в средних и крупных лабораториях. Инновационные достижения в области химии секвенирования, дизайн проточной ячейки высокой плотности и алгоритмов идентификации оснований обеспечивают пользователям существенную гибкость, стабильное качество данных и ускоренное получение высококачественных данных. SURFSeq 5000 обладает одновременной поддержкой двух независимых проточных ячеек (FCM-на 500M и FCH-2000M прочтений) и способен считывать несколько длин последовательностей:

  • SE100 (FCM) за 12 часов, SE50 (FCH) за 14 часов
  • PE100 (FCM) за 18 часов, PE100 (FCH) за 34 часа
  • PE150 (FCM) за 24 часа,PE150 (FCH) за 47 часов

Качество данных при Q30 >85%, точность > 99%


Рабочие параметры SURFSeq 5000 в сравнении

Характеристики Illumina NextSeq 2000 SURFSeq 5000 GenoLab M FASTASeq 300
Макс. прочтений за запуск 100 - 1200M 2000M 250 - 1000M 100-250M
Количество независимых ячеек 1 2 2 1
Время секвенирования PE150, часов max 48 47 53 21
Количество данных за запуск  360 Gb 1200 Gb 300 Gb 75 Gb

Принцип секвенирования

  • Готовятся библиотеки с адаптерами комплементарными поверхности ячейки для секвенирования.
  • Связанные с ячейкой библиотеки амплифицируются в моноклональных кластерах.
  • Далее библиотеки секвенируются за счет обратимой терминации и флуоресцентно меченых нуклеотидов.

Надежность и Гибкость

SURF-seqTM - технология секвенирования с использованием четырех меченых разными флуорофорами нуклеотидов, 3′-конец которых заблокирован (обратимые терминаторы).

Каждая ячейка может быть загружена независимо от второй, поэтому две дорожки на картридже могут работать параллельно с разными образцами или типами секвенирования, что позволяет сократить время работы прибора и расширить сферы его применения в рамках одного эксперимента.

В комплект поставки входит первичное техническое обслуживание, инсталляция, инструктаж пользователя и гарантийный СЕРВИС.



Интерпретация результатов

В комплект поставки опционально входит специализированное программное обеспечение Oncobox для анализа и интерпретации NGS данных (на 10, 24, 48 или 96 образцов) при онкодиагностике и онкологических исследованиях.

Отчет Oncobox включает в себя анализ геномных (ДНК) и транскриптомных (РНК) данных, полученных из образца опухоли, содержит рейтинг эффективности таргетных и иммунотерапевтических препаратов для конкретного пациента.