Технологии
Совместимость
Новый уровень качества
SURFSeq Q является напольной системой сверхвысокопроизводительного секвенирования. Она ориентирована в первую очередь на полногеномное, полноэкзомное, транскиптомное (в том числе пространственное) и single cell секвенирование на уровне популяций в крупных лабораториях. Инновационные достижения в области химии секвенирования, дизайн проточной ячейки высокой плотности и ИИ алгоритмов идентификации оснований обеспечивают пользователям существенную гибкость, стабильное качество данных и ускоренное получение высококачественных данных. SURFSeq Q обладает одновременной поддержкой двух независимых проточных ячеек (FCM-на 500M и FCH-2000M прочтений) и способен считывать несколько длин последовательностей:
- SE100 (FCM) за 13 часов, SE50 (FCH) за 17 часов
- PE100 (FCM) за 19 часов, PE100 (FCH) за 29 часа
- PE150 (FCM) за 24 часа,PE150 (FCH) за 36 часов
Качество данных при Q40 >90%, точность > 99%
Рабочие параметры SURFSeq 5000 в сравнении
| Характеристики |
SURFSeq Q |
SURFSeq 5000 | GenoLab M | FASTASeq 300 |
| Макс. прочтений за запуск | 23.3B | 2000M | 250 - 1000M | 100-250M |
| Количество независимых ячеек | 2 | 2 | 2 | 1 |
| Время секвенирования PE150, часов max | 36 | 47 | 53 | 21 |
| Количество данных за запуск | 14 Tb | 1200 Gb | 300 Gb | 75 Gb |
Принцип секвенирования
- Готовятся библиотеки с адаптерами комплементарными поверхности ячейки для секвенирования.
- Связанные с ячейкой библиотеки амплифицируются в моноклональных кластерах.
- Далее библиотеки секвенируются за счет обратимой терминации и флуоресцентно меченых нуклеотидов.
Надежность и Гибкость
SURF-seqTM - технология секвенирования с использованием четырех меченых разными флуорофорами нуклеотидов, 3′-конец которых заблокирован (обратимые терминаторы).
Каждая ячейка может быть загружена независимо от второй, поэтому две дорожки на картридже могут работать параллельно с разными образцами или типами секвенирования, что позволяет сократить время работы прибора и расширить сферы его применения в рамках одного эксперимента.
В комплект поставки входит первичное техническое обслуживание, инсталляция, инструктаж пользователя и гарантийный СЕРВИС.
Интерпретация результатов
В комплект поставки опционально входит специализированное программное обеспечение Oncobox для анализа и интерпретации NGS данных (на 10, 24, 48 или 96 образцов) при онкодиагностике и онкологических исследованиях.
Отчет Oncobox включает в себя анализ геномных (ДНК) и транскриптомных (РНК) данных, полученных из образца опухоли, содержит рейтинг эффективности таргетных и иммунотерапевтических препаратов для конкретного пациента.
