Технологии
Совместимость
Новый уровень качества
Геноскан 4000 является настольной системой высокопроизводительного секвенирования с регистрационным удостоверением в РФ (РЗН 2025/24616 от 31 января 2025). Она ориентирована в первую очередь на полногеномное, полноэкзомное и транскиптомное секвенирование. Инновационные достижения в области химии секвенирования, дизайн проточной ячейки высокой плотности и алгоритмов идентификации оснований обеспечивают пользователям существенную гибкость, стабильное качество данных и ускоренное получение высококачественных данных. Геноскан 4000 обладает одновременной поддержкой двух проточных ячеек (FCM-на 250M и FCH-500M прочтений) и способен считывать несколько длин последовательностей:
- SE75 (FCM) за 13 часов, SE75 (FCH) за 17 часов
- PE75 (FCM) за 24 часа, PE75 (FCH) за 30 часов
- PE150 (FCM) за 43 часа, PE150 (FCH) за 53 часа
Качество данных при Q30 >80%, точность > 99%
Рабочие параметры Геноскан 4000 в сравнении
| Характеристики | Illumina NextSeq 2000 | Геноскан 4000 | FASTASeq 300 |
| Макс. прочтений за запуск | 100 - 1200M | 250 - 1000M | 100-250M |
| Количество независимых ячеек | 1 | 2 | 1 |
| Время секвенирования PE150, часов max | 48 | 53 | 21 |
| Количество данных за запуск | 360 Gb | 300 Gb | 75 Gb |
Принцип секвенирования
- Готовятся библиотеки с адаптерами комплементарными поверхности ячейки для секвенирования.
- Связанные с ячейкой библиотеки амплифицируются в моноклональных кластерах.
- Далее библиотеки секвенируются за счет обратимой терминации и флуоресцентно меченых нуклеотидов.
Надежность и Гибкость
SURF-seqTM - технология секвенирования с использованием четырех меченых разными флуорофорами нуклеотидов, 3′-конец которых заблокирован (обратимые терминаторы).
Каждая ячейка может быть загружена независимо от второй, поэтому две дорожки на картридже могут работать параллельно с разными образцами или типами секвенирования, что позволяет сократить время работы прибора и расширить сферы его применения в рамках одного эксперимента.
В комплект поставки входит первичное техническое обслуживание, инсталляция, инструктаж пользователя и гарантийный СЕРВИС.
Интерпретация результатов
В комплект поставки опционально входит специализированное программное обеспечение Oncobox для анализа и интерпретации NGS данных (на 10, 24, 48 или 96 образцов) при онкодиагностике и онкологических исследованиях.
Отчет Oncobox включает в себя анализ геномных (ДНК) и транскриптомных (РНК) данных, полученных из образца опухоли, содержит рейтинг эффективности таргетных и иммунотерапевтических препаратов для конкретного пациента.
Подробнее


